Pacific Biosciences Sequel I – DNA-Sequenziersystem

Third-Generation Long-Read Sequencing • SMRT®-Technologie

Beschreibung

Das Pacific Biosciences Sequel I System ist ein DNA-Sequenziersystem der Third Generation auf Basis der SMRT®-Technologie (Single Molecule, Real-Time).

• Entwickelt für Long-Read-Sequenzierung mit hoher Genauigkeit, wird das System vor allem in der Genomforschung, Epigenetik sowie bei der Analyse struktureller Varianten eingesetzt.: 🔬 Systemübersicht
• Hersteller: Pacific Biosciences (PacBio)
• Modell: Sequel I
• Technologie: SMRT® (Single Molecule Real-Time Sequencing)
• Markteinführung: ca. 2015
• Erstinbetriebnahme: 2018
• ⚙️ Technische Kerndaten (typisch): Sequenzierung
• Ø Read-Längen: 10–15 kb
• Reads > 60 kb möglich
• Einzel-Read-Genauigkeit: ca. 85–90 %
• HiFi / CCS Reads: bis >99 % (lauf- & chemieabhängig)
• Echtzeit-Fluoreszenz einzelner DNA-Polymerasen
  SMRT Cells
• Typ: SMRT Cell 1M
• ZMWs: ca. 1 Mio.
• 1 Lauf pro SMRT Cell
  Durchsatz
• Ca. 5–10 Gb pro Lauf
• Laufzeit: ca. 10–30 Stunden

Rechner & Software

• PacBio SMRT Link Software
• Datenformate: BAM, FASTQ u. a.
• Unterstützung für De-novo-Assembly, Iso-Seq, Epigenetik

Abmessungen & Anschlüsse (ca.)

• Standgerät / Tischsystem
• Gewicht: ca. 250–300 kg
• Stromversorgung: 200–240 V AC
• Klimatisierte Laborumgebung erforderlich

Typische Einsatzgebiete

• De-novo-Genomassemblierung
• Strukturelle Varianten (SVs)
• Wiederholungsreiche Genome
• Iso-Seq (Full-Length-Transkripte)
• Epigenetische Modifikationen (z. B. Methylierung)
• ⚠️ Wichtiger Hinweis: Lieferung erfolgt ohne Software und ohne Steuerrechner.
  Verkauf der reinen Hardware.
  Gewerblicher Verkauf.